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虽然果胶被发现近200年，但目前对于其组成和结构并没有彻底弄清楚。果胶结构非常难解析的原因在于其结构和组成随着植物的种类、储藏期和加工工艺的不同而不同。此外，果胶中还存在一些杂质。根据果胶分子主链和支链结构的不同，将其分为4类：同型半乳糖醛酸聚糖（Homogalacturonan，HG）、鼠李半乳糖醛酸聚糖 I（Rhamngalacturonan I，RGI）、鼠李半乳糖醛酸聚糖II（Rhamngalacturonan II，RGII）和木糖半乳糖醛酸聚糖（Xylogalacturonan，XG）。 HG是长而连续、平滑的α-1,4糖苷键连接的半乳糖醛酸聚合体，约占果胶的65％，半乳糖醛酸的C6可被甲酯化或酰胺化，在一些植物中，C2或C3可被乙酰化。 也有研究发现HG中半乳糖醛酸残基的O-3或O-4被木糖取代，形成XG。 RGI（20％~35％）是一个具有侧链区域的骨架，是由几十甚至超过100个重复鼠李半乳糖醛酸二糖构成。通常RGI中的鼠李糖残基有20％~80％被中性糖支链取代，取代位置通常在C4位，而RGI的支链长度和种类与果胶原料来源和提取方式有关。 这些支链可分为3种多聚体：阿拉伯聚糖、阿拉伯半乳聚糖I和阿拉伯半乳聚糖II。 吉林四平回收橡胶原料行情 阿拉伯半乳聚糖I由(1,4)-α-D-Gal-(1,5)-α-L-Ara 组成，通过(1,4)-α-L-Ara 与主链相连；阿拉伯半乳聚糖II是高度分枝的半乳聚糖， 侧链的主链由(1,3)-α-D-Gal 组成，该主链被(1,6)-α-D-Gal取代成分枝，而该分枝则被(1,3)-α-L-Ara取代。 RGII（约10％）的结构非常复杂 ，其骨架是带有4个不同侧链的短而伸长的 HG， 而非鼠李半乳糖醛酸聚糖，RGII由至少12种单糖以多于20种的键合方式连接。 在植物中，RGII 可与硼酸盐发生交联。
随着人们对营养的关注以及在果胶构效关系方面取得了一定的成绩，于是人们试图对果胶的一些结构进行人为的修饰，以得到某些具有特殊功能的果胶产品，这类果胶称为修饰果胶或改性果胶（modified pectin，MP）。果胶可通过化学、物理和生物，包括酶法来改性。 目前对于果胶的改性已取得一些成绩，这方面的研究也将是今后发展的一个趋势。 [2] 果胶的改性多采用pH法。pH改性果胶是指把酸法提取的果胶进行碱处理（一般调pH至10），在相对温和的温度（50~60 ℃）下孵育一定的时间，大多研究采用60min，然后再调pH至酸性（一般调至3左右）。其主要原理是基于在中性或碱性条件下，尤其是升高温度，果胶溶液会快速且大量降解，包括HG与RG主链糖苷键断裂，对主链上的半乳糖醛酸部分进行脱酯化，分解支链上的中性糖等。反应的机制主要是首先果胶分子在碱性条件下发生β-反应和去酯反应，使得HG主链断裂，生成一些聚半乳糖醛酸低聚物和RGI；然后在酸性条件下去掉一些支链的中性糖，尤其是阿拉伯糖残基， 的MP将是富含半乳糖链和阿拉伯聚半乳糖链的GI，吉林四平回收橡胶原料行情
